Das wissenschaftliche Ziel des Projekts ist es, die neueste Entwicklung in der DNA-Quantifizierungstechnologie, genannt digitale PCR (dPCR), mit der Detektion auf einem markierungsfreien optischen Microarray zu kombinieren. Bei der dPCR gibt es bereits einige Multiplex-Methoden, jedoch ist das Ausmaß des Multiplexings durch die Anzahl der Fluoreszenz-Detektionskanäle begrenzt. Mit der Möglichkeit, mehrere Produkte gleichzeitig zu amplifizieren, zu detektieren und zu identifizieren, könnte die Praktikabilität und Kosteneffizienz des Ansatzes deutlich verbessert werden. Im Projekt werden Multiplex-dPCR-Protokolle entwickelt, die eine Kopplung mit optischen Microarrays ermöglichen. Auf der anderen Seite wird eine markierungsfreie Detektion von DNA unter Verwendung eines plasmonischen Microarrays für den Einsatz in dieser Anwendung angepasst, einschließlich des Designs und der Erprobung der erforderlichen Fängersonden für die Bindung der amplifizierten DNA, des Designs und der Realisierung einer dedizierten mikrofluidischen Durchflusszelle, der optischen (multiplexen) Detektion des Arrays und der Signalverarbeitungssoftware. Der Schwerpunkt liegt auf Methoden zum Nachweis von Pflanzenpathogenen, Viren und gentechnisch veränderten Organismen (GMOs).

Das Projekt wird gefördert durch DAAD unter der Nummer 57448712.