Das Projekt NEXD untersucht neue Wege für die molekulare Diagnostik schwer nachweisbarer Infektionserkrankungen. Im Fokus steht die Analyse zellfreier DNA (cell-free DNA, cfDNA), die Krankheitserreger auch dann nachweisbar macht, wenn klassische mikrobiologische Verfahren an ihre Grenzen stoßen. Das Projekt adressiert insbesondere Infektionen wie Endokarditis und invasive pulmonale Aspergillose, bei denen eine schnelle und verlässliche Diagnostik entscheidend ist.

Zentrales Ziel von NEXD ist die Entwicklung eines neuartigen Extraktionsverfahrens auf Basis von Nanoreaktor-Beads der BLINK AG. Diese Beads ermöglichen die effiziente Anreicherung von Nukleinsäuren aus großen Probenvolumina. Die Methode eignet sich für unterschiedliche Probentypen, darunter Plasma, Urin und Abstriche, und erlaubt eine standardisierte Aufarbeitung auch bei sehr geringen DNA-Konzentrationen.

Der molekulare Nachweis erfolgt über digitale Multiplex-PCR, die eine sensitive und parallele Detektion vieler Zielsequenzen erlaubt. In Kombination mit einer biasarmen Sequenzierung lassen sich Erregerprofile ohne vorab formulierte Verdachtsdiagnose erfassen. Dadurch wird eine umfassende Mikrobiomanalyse möglich, die sowohl bekannte als auch unerwartete Pathogene einschließt.

Ergänzend entwickelt NEXD KI-gestützte Softwarelösungen zur Auswertung der komplexen Daten. Die automatisierte Analyse erleichtert die Interpretation der Ergebnisse, reduziert den manuellen Aufwand und senkt die Kosten der Diagnostik. Ziel ist ein Verfahren, das schneller verfügbare und belastbare Ergebnisse liefert und sich perspektivisch in den klinischen Alltag integrieren lässt.